As capturas serã realizadas com duas baterias de redes de espera contendo oito redes, com diferentes tamanhos de malha (3 cm á 12 cm, entre nós opostos), peneiras e puças. Todas as redes permaneceram durante 12 horas nos locais. Já as peneiras e os puças serão usados realizando-se o mesmo número de repetições (10) em cada ponto de coleta.

Os peixes capturados em cada coleta serão pesados e medidos, separados em sacos plásticos contendo informações sobe a época do ano, local e o tipo de aparelho usado na coleta. Em seguida, os exemplares serão fixados em formol 10% e conservados em álcool 70%, armazenados em recipientes plásticos e transportados para o laboratório do CRHEA-USP-São Carlos, onde serão identificados com o auxílio de chaves de identificação (Britski, 1972; Britski et al., 1984). Posteriormente as espécies serão utilizadas para a análise ecomorfológica.

Alguns autores utilizaram para a análise ecomorfológica, espécies dominantes, que apresentavam mais de 10 indivíduos adultos representados na coleção. Para estas espécies serão registradas 18 medidas morfométricas, utilizadas nos cálculos dos atributos ecomorfológico que podem caracterizar tipos de hábitos de vida ou adaptações das espécies à ocupação de diferentes ambientes (Balon et al. 1996; Beumord, 1991; Smith, 1999; Gatz, 1981).

Após a obtenção dos atributos ecomorfológicos, será realizada uma Análise de Componentes Principais (PCA). O objetivo desta análise neste trabalho é auxiliar a geração de hipóteses (Digby & Kempton, 1987) utilizando os dados ambientais obtidos em cada estação é também nos atributos ecomorfológicos, permitindo a ordenação das espécies de acordo com a estrutura do corpo, indicando as principais adaptações morfológicas e possíveis diferenças na partilha por recursos.